scipy.stats.nchypergeom_fisher#

scipy.stats.nchypergeom_fisher = <scipy.stats._discrete_distns.nchypergeom_fisher_gen object>[source]#

費雪非中心超幾何離散隨機變數。

費雪非中心超幾何分佈模型描述從一個箱子中抽取兩種物體的過程。M 是物體的總數,n 是 Type I 物體的數量,而 odds 是勝算比:當每種類型只有一個物體時,選擇 Type I 物體而不是 Type II 物體的機率比。 隨機變數表示從箱子中一次取出一把物體後,發現我們取了 N 個物體,其中 Type I 物體的數量。

作為 rv_discrete 類別的一個實例,nchypergeom_fisher 物件從它繼承了一系列通用方法(完整列表請見下方),並以針對此特定分佈的細節來完善它們。

註解

令數學符號 \(N\)\(n\)\(M\) 分別對應於上述定義的參數 NnM

機率質量函數定義為

\[p(x; M, n, N, \omega) = \frac{\binom{n}{x}\binom{M - n}{N-x}\omega^x}{P_0},\]

for \(x \in [x_l, x_u]\), \(M \in {\mathbb N}\), \(n \in [0, M]\), \(N \in [0, M]\), \(\omega > 0\), where \(x_l = \max(0, N - (M - n))\), \(x_u = \min(N, n)\),

\[P_0 = \sum_{y=x_l}^{x_u} \binom{n}{y}\binom{M - n}{N-y}\omega^y,\]

and the binomial coefficients are defined as

\[\binom{n}{k} \equiv \frac{n!}{k! (n - k)!}.\]

nchypergeom_fisher 使用 Agner Fog 的 BiasedUrn 套件,並獲得許可在 SciPy 的授權下發布。

用於表示形狀參數(NnM)的符號並非普遍接受; 選擇它們是為了與 hypergeom 一致。

請注意,費雪非中心超幾何分佈與 Wallenius 非中心超幾何分佈不同,後者模型描述的是從箱子中逐一抽取預先確定的 N 個物體的過程。 然而,當勝算比為 1 時,這兩種分佈都簡化為普通的超幾何分佈。

上面的機率質量函數以「標準化」形式定義。 若要移動分佈,請使用 loc 參數。 具體來說,nchypergeom_fisher.pmf(k, M, n, N, odds, loc)nchypergeom_fisher.pmf(k - loc, M, n, N, odds) 完全等效。

參考文獻

[2]

“費雪非中心超幾何分佈”,維基百科,https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher’s_noncentral_hypergeometric_distribution

範例

>>> import numpy as np
>>> from scipy.stats import nchypergeom_fisher
>>> import matplotlib.pyplot as plt
>>> fig, ax = plt.subplots(1, 1)

計算前四個動差

>>> M, n, N, odds = 140, 80, 60, 0.5
>>> mean, var, skew, kurt = nchypergeom_fisher.stats(M, n, N, odds, moments='mvsk')

顯示機率質量函數 (pmf)

>>> x = np.arange(nchypergeom_fisher.ppf(0.01, M, n, N, odds),
...               nchypergeom_fisher.ppf(0.99, M, n, N, odds))
>>> ax.plot(x, nchypergeom_fisher.pmf(x, M, n, N, odds), 'bo', ms=8, label='nchypergeom_fisher pmf')
>>> ax.vlines(x, 0, nchypergeom_fisher.pmf(x, M, n, N, odds), colors='b', lw=5, alpha=0.5)

或者,可以呼叫分佈物件(作為函數)來固定形狀和位置。 這會傳回一個「凍結」的 RV 物件,其中保存了給定的固定參數。

凍結分佈並顯示凍結的 pmf

>>> rv = nchypergeom_fisher(M, n, N, odds)
>>> ax.vlines(x, 0, rv.pmf(x), colors='k', linestyles='-', lw=1,
...         label='frozen pmf')
>>> ax.legend(loc='best', frameon=False)
>>> plt.show()
../../_images/scipy-stats-nchypergeom_fisher-1_00_00.png

檢查 cdfppf 的準確性

>>> prob = nchypergeom_fisher.cdf(x, M, n, N, odds)
>>> np.allclose(x, nchypergeom_fisher.ppf(prob, M, n, N, odds))
True

產生隨機數

>>> r = nchypergeom_fisher.rvs(M, n, N, odds, size=1000)

方法

rvs(M, n, N, odds, loc=0, size=1, random_state=None)

隨機變數。

pmf(k, M, n, N, odds, loc=0)

機率質量函數。

logpmf(k, M, n, N, odds, loc=0)

機率質量函數的對數。

cdf(k, M, n, N, odds, loc=0)

累積分布函數。

logcdf(k, M, n, N, odds, loc=0)

累積分布函數的對數。

sf(k, M, n, N, odds, loc=0)

生存函數(也定義為 1 - cdf,但 sf 有時更準確)。

logsf(k, M, n, N, odds, loc=0)

生存函數的對數。

ppf(q, M, n, N, odds, loc=0)

百分點函數(cdf 的反函數 — 百分位數)。

isf(q, M, n, N, odds, loc=0)

反生存函數(sf 的反函數)。

stats(M, n, N, odds, loc=0, moments=’mv’)

平均值('m')、變異數('v')、偏度('s')和/或峰度('k')。

entropy(M, n, N, odds, loc=0)

RV 的(微分)熵。

expect(func, args=(M, n, N, odds), loc=0, lb=None, ub=None, conditional=False)

函數(單一參數)相對於分佈的期望值。

median(M, n, N, odds, loc=0)

分佈的中位數。

mean(M, n, N, odds, loc=0)

分佈的平均值。

var(M, n, N, odds, loc=0)

分佈的變異數。

std(M, n, N, odds, loc=0)

分佈的標準差。

interval(confidence, M, n, N, odds, loc=0)

圍繞中位數的等面積信賴區間。